编者按：特发性膜性肾病（Idiopathic Membranous Nephropathy, IMN）是成人肾病综合征的主要病因之一，其发病机制与磷脂酶A2受体（Phospholipase A2 Receptor, PLA2R）密切相关。近年来，随着对PLA2R在IMN中作用机制的深入研究，寻找与PLA2R相关的诊断生物标志物成为研究热点。近期，一项最新研究通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）和LASSO回归算法，筛选出与PLA2R相关的潜在诊断生物标志物，并在临床样本中进行了验证。

研究背景

膜性肾病（Membranous Nephropathy, MN）是成人肾病综合征的重要组成部分，占肾病综合征病例的25%~40%。IMN是一种器官特异性自身免疫性疾病，其病理特征包括肾小球基底膜弥漫性增厚、免疫球蛋白G（IgG）和补体3（C3）的颗粒状沉积，以及上皮下电子致密物沉积。PLA2R作为M型磷脂酶A2受体，是IMN的关键自身抗原，其在足细胞上的表达与IMN的发生密切相关。因此，深入研究PLA2R相关基因和通路在IMN发病机制中的作用，对于寻找新的治疗靶点具有重要意义。

研究方法

该研究从GEO数据库中获取了膜性肾病数据集（GSE115857和GSE200828），并使用“limma”R包进行差异基因表达分析。通过WGCNA筛选与PLA2R相关的模块和基因，并与差异基因进行交集。随后，利用LASSO回归分析筛选出特征基因，并通过ROC分析评估其敏感性和特异性。最终，通过qPCR检测PLA2R阳性患者的特征基因表达水平。

数据处理与差异基因分析

研究整合了GSE115857和GSE200828数据集，并使用“sva”R包中的combat函数消除批次效应。通过“limma”R包分析，共筛选出117个差异表达基因（DEGs），其中59个上调，58个下调。这些基因在IMN患者组织中的表达水平显著高于正常组织，表明其可能在IMN的发病机制中发挥重要作用。

蛋白质-蛋白质相互作用网络构建

利用STRING数据库，研究者构建了差异表达基因的蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络，并通过Cytoscape软件进行可视化分析。基于MCC算法，筛选出10个关键节点基因作为核心基因。这些核心基因在细胞内的相互作用网络中占据重要位置，可能对IMN的病理过程具有关键调控作用。

功能富集分析

通过DAVID网站进行的基因本体（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析显示，差异表达基因主要富集在与高尔基体相关的囊泡膜、转录共调控因子结合以及糖皮质激素响应等生物学过程中。KEGG分析进一步揭示了这些基因在PPAR信号通路中的显著富集，提示该通路可能在IMN的发病机制中发挥重要作用。

WGCNA分析

通过对IMN表达矩阵的分析，研究者构建了加权基因共表达网络，并筛选出与PLA2R相关的模块。最终确定的棕色模块包含440个基因，与IMN和PLA2R均呈高度正相关。这些基因被定义为PLA2R相关膜性肾病的关键基因，为进一步筛选诊断标志物提供了基础。

特征基因筛选与验证

通过LASSO回归分析，研究者从候选基因中筛选出12个特征基因，并使用ROC曲线分析评估其诊断价值。结果显示，其中7个基因（ECM1、SLC19A2、RASD1、FOSB、KDELR3、ZFP36和ELF4）的AUC值大于0.9，表明这些基因具有较高的诊断敏感性和特异性。进一步在GSE133288数据集中验证这些基因的诊断价值，结果表明ECM1、SLC19A2、RASD1、FOSB和ZFP36的AUC值均大于0.8，具有良好的诊断潜力。

临床样本验证

研究者通过免疫组化（IHC）分析检测了PLA2R阳性患者肾组织中特征基因的表达水平。结果显示，ECM1、SLC19A2、PLA2R和ZFP36在IMN组织中表达上调，而RASD1和FOSB表达下调。此外，将PLA2R阳性患者的血清加入人足细胞后，细胞活性显著降低，细胞凋亡显著增加，而RASD1过表达则可显著提高细胞活性并减少凋亡，表明RASD1在IMN中可能具有保护作用。

关键结论

该研究通过WGCNA和LASSO回归算法，筛选出与PLA2R相关的潜在诊断生物标志物，包括ECM1、SLC19A2、RASD1、FOSB、KDELR3、ZFP36和ELF4。这些基因在IMN患者中的表达水平与疾病状态密切相关，且在临床样本中得到了验证。研究结果不仅为PLA2R相关IMN的诊断提供了新的生物标志物，还为未来的治疗靶点开发提供了理论依据。

研究局限性

尽管本研究在多个数据集中验证了筛选出的生物标志物的诊断价值，但仍存在一些局限性。首先，样本量较小，尤其是对照组样本量有限，可能影响结果的可靠性。其次，由于使用的数据集未提供详细的年龄、性别、种族或合并症信息，无法充分考虑这些潜在混杂因素的影响。未来的研究计划使用更多样本的数据集，进一步增强研究的统计功效和结果的可靠性，并纳入不同种族和人群的样本进行验证，以评估研究结果的跨种族普遍性。

参考文献：Huang J, et al. Renal Failure. 2025; 47(1）: 2438859.