近期，一项聚焦肠道菌群与估算肾小球滤过率（eGFR）关联的迄今最大规模、深度分析研究在线发表于国际肾脏病协会（ISN）官方期刊Kidney International。该研究以瑞典两个独立人群为队列（发现队列和验证队列），结合深度宏基因组测序、血浆代谢组学等技术，首次系统揭示了肠道菌群多样性、特定物种及其代谢通路与社区成年人肾功能的独立关联，证实肠道-肾脏轴在肾功能早期变异中的关键作用。

一、研究背景与目的

慢性肾脏病（CKD）在普通人群中高发，且与高发病率、死亡率相关，早期保护肾功能对改善预后至关重要。肠道-肾脏轴的相互作用已被证实，但现有研究多聚焦于重症肾病患者，针对肾功能基本保留的社区成年人的大样本研究十分匮乏，且缺乏宏基因组与代谢组的联合分析。本研究旨在通过两个瑞典人群队列，量化肠道菌群与eGFR的关联，挖掘与肾功能相关的核心菌群物种、代谢通路及关键代谢物，明确肠道菌群在肾功能早期变化中的作用。

二、研究设计与研究对象

1.研究队列：采用经典的发现-验证设计，总纳入12015名社区成年人，均为欧洲/瑞典裔，整体肾功能状态良好：①发现队列：瑞典心肺生物影像研究（SCAPIS），纳入9798人，平均年龄58±4岁，女性占52.4%，8.5%合并糖尿病；②验证队列：马尔默后代研究（MOS），纳入2080人，平均年龄40±14岁，女性占52.3%，仅2.4%合并糖尿病。

2.核心检测指标：①肾功能：以CKD-EPI公式基于血肌酐计算eGFR为主要结局，同时检测尿白蛋白-肌酐比（UACR）；②肠道菌群：粪便样本深度宏基因组测序，分析494种相对丰度>0.01%且在30%以上研究对象中存在的物种，计算Shannon、逆辛普森指数（inverse Simpson）等α-多样性指标；③代谢组学：SCAPIS队列行非靶向血浆代谢组学检测，筛选出1010种有效代谢物；④协变量：涵盖人口学特征、心血管危险因素、用药史、白蛋白尿等。

3.统计方法：采用线性回归分析菌群与eGFR的关联，经多模型校正（人口学/技术因素、UACR、心血管危险因素）并控制假发现率；通过随机森林模型评估菌群对eGFR变异的解释度；采用通路富集分析、偏Spearman相关分析揭示菌群-代谢物-eGFR的关联；同时开展多项敏感性分析验证结果稳健性。

三、核心发现

1.肠道菌群α-多样性与eGFR呈轻度逆相关：两个队列中均观察到菌群α-多样性（Shannon、逆辛普森、Chao1）与eGFR的统计学显著负相关，但效应量较小，提示在肾功能健康的人群中，菌群多样性升高与肾功能轻度降低相关，且该关联独立于传统危险因素。

2.鉴定出44种与eGFR稳定关联的核心细菌物种：在SCAPIS中筛选出223种与eGFR显著相关的物种，经MOS队列验证后，44种物种呈方向一致的显著关联，其中仅5种（如瘤胃球菌、变形链球菌、罗氏菌）与eGFR正相关，其余39种均为负相关。这44种物种通过随机森林模型可共同解释7%的eGFR变异，且经排除抗生素使用者、炎症性肠病患者，校正质子泵抑制剂使用等敏感性分析后，结果仍稳健；部分物种（如马赛肠杆菌）在多种统计模型中均被鉴定为核心关联物种，具有重要生物学意义。

3.菌群相关代谢通路以组氨酸和肉碱代谢为核心：通路富集分析显示，与eGFR关联物种显著富集于组氨酸代谢和肉碱代谢通路，为排名前两位的核心通路；功能分析发现，高eGFR与菌群的发酵代谢通路（乙醇、乳酸产生）相关，低eGFR则与分解代谢通路（淀粉降解、乙酰辅酶A生成）相关，提示菌群代谢功能的改变与肾功能状态密切相关。

4.菌群相关代谢物解释51%的eGFR变异，关键毒性代谢物为核心介质：44种核心物种与1010种血浆代谢物存在16689个显著关联，这些代谢物可共同解释51%的eGFR变异，远高于菌群本身的解释度。其中，肉碱代谢产物三甲基胺N-氧化物（TMAO）、组氨酸代谢产物咪唑丙酸为关键关联代谢物，二者均与eGFR呈显著负相关，是介导肠道菌群影响肾功能的核心循环介质。

5.菌群关联独立于传统危险因素：菌群与eGFR的关联在校正年龄、性别、糖尿病、高血压、白蛋白尿、心血管用药等传统危险因素后仍显著，且44种核心物种的解释度约为传统临床预测因子的一半，证实肠道菌群是肾功能的独立影响因素。

四、研究结论

肠道微生物多样性、44种可跨队列验证的核心细菌物种与社区成年人的肾功能独立相关，这些物种共同解释了7%的eGFR变异；肠道菌群介导的组氨酸和肉碱代谢通路激活，及其产生的TMAO、咪唑丙酸等循环代谢物，是导致eGFR变异的重要原因，相关代谢物可解释51%的eGFR变异。研究证实，肠道-肾脏轴的相互作用在肾功能早期变化中即已存在，肠道菌群及其代谢产物是肾功能保护的可干预靶点，为通过调节肠道菌群预防早期肾功能损伤提供了全新的研究方向。

参考文献
Lin YT, et al.  Association between the gut microbiota and estimated glomerular filtration rate in two Swedish population-based cohorts, Kidney International (2026), doi: https://doi.org/10.1016/j.kint.2026.01.021.